Aunque Baidu Cleaner hará una sugerencia del tipo de archivos que podrían eliminarse, primará el criterio del propio usuario que podrá elegir aquellos que quiere eliminar, por si nos interesará guardar aquellos relacionados con las páginas webs visitadas o determinada información privada en otros programas. Se echa en falta un mayor grado de control, al no poder listarse todos los archivos de manera individual y no poder por tanto limitar la limpieza del equipo a nuestra completa elección.
Baidu Cleaner es además compatible con más de 5.000 programas, entre los que se encuentran los más populares, por lo que no habrá problemas en que el programa reconozca los datos o procesos que verdaderamente pueden ser un lastre para el funcionamiento del ordenador. La aplicación permite además programar recordatorios para informar sobre la necesidad de mantener el equipo limpio o crear alertas cuando se instala algún programa sin permiso, que pueda contener este tipo de elementos molestos, que más tarde podremos eliminar.